據悉，合并納稅是指母公司在合并其子公司年度企業所得稅納稅申報表的基礎上，統一計算年度應納稅所得額及應納所得稅額，統一申報繳納企業所得稅。按照法人所得稅原則，母、子公司應當分別作為獨立納稅人各自繳納所得稅，企業之間不得合并繳納企業所得稅。

    今年起執行的新企業所得稅法的一大變化，就是實行法人所得稅制度。并規定企業的非法人獨立核算的分支機構將自動匯總到法人（總部）繳納所得稅。這一變化，意味著具有法人資格的大企業集團將匯總繳納所得稅。匯總納稅的最大好處，是大企業集團各分支機構可以盈虧互抵，從而減輕稅收負擔。稅法授權國務院對符合一定條件的母子公司，允許實行合并納稅，但是允許合并納稅的條件十分嚴格。

    有關專家分析認為，由于合并納稅和匯總納稅等情況的存在，導致很多在中西部地區經營的企業納稅卻是在北京、上海等總部所在地，相當于落后地區在財政收入上補貼發達地區，進一步加大了區域間的差距。因此，這些大企業集團從2009年起停止合并納稅，將會部分緩解區域稅收轉移的問題，增加地方政府財力，使其能夠擴大支出保障區域經濟發展。